Чтобы исследовать работу гена, биологам полезно изменить его и посмотреть, что произойдёт с клеткой. CRISPR-Cas9 стал одним из инструментов, которые сделали такие эксперименты доступнее. Его происхождение связано с защитными системами бактерий: они помогают распознавать генетический материал вторгающихся вирусов. Исследователи приспособили этот принцип для направленного редактирования ДНК. Как это объясняет NHGRI.
Молекулярный адрес и разрез
В упрощённой схеме нужны два главных компонента. Короткая направляющая РНК задаёт участок, с которым должен связаться комплекс. Белок Cas9 выполняет разрез ДНК в выбранной области. Исследователь меняет последовательность направляющей РНК, чтобы направить инструмент к другой мишени.
Дальше в работу вступают системы восстановления самой клетки. Итогом может стать нарушение работы гена или заданное изменение последовательности. Поэтому выражение «генетические ножницы» удобно для первого знакомства, но не описывает весь процесс: найти участок, разрезать ДНК и получить нужный результат — разные этапы.
Зачем нужны разные редакторы
Современное редактирование генома не ограничивается классическим Cas9. Базовые редакторы предназначены для изменения отдельных «букв» ДНК, а прайм-редактирование позволяет вносить более разнообразные изменения. Выбор инструмента зависит от конкретной задачи. Обзор подходов Broad Institute.
Для практического применения важна и доставка: редактор должен попасть в нужные клетки и ткани. Успешный результат в лабораторной клеточной культуре ещё не отвечает на все вопросы о работе метода в организме. Поэтому при чтении новостей о CRISPR стоит обращать внимание на объект исследования и на то, какое именно изменение удалось подтвердить.